เมื่อวันที่ 20 ตุลาคม 2552 คณะวิทยาศาสตร์ฯ ได้จัดพิธีทำบุญเนื่องในวันคล้ายวันสถาปนาคณะฯ ประจำปี 2552 และ ปาฐกถาศาสตราจารย์ สตางค์ มงคลสุข ครั้งที่ 17 ขึ้น โดยในช่วงเช้าจัดให้มีพิธีทำบุญถวายภัตตาหารเพลแก่พระสงฆ์จากวัดเบญจมบพิตรดุสิตวนาราม จำนวน 9 รูป หลังจากนั้นมีการมอบรางวัลในกิจกรรมประกวดบัตรอวยพรปีใหม่ ประจำปี 2553 รางวัลชนะเลิศ ชื่อผลงาน สวัสดีปีใหม่ "กันภัยมหิดล" โดยนายวิรัชร์ กาจนการุณ นักศึกษาคณะวิทยาศาสตร์ สาขาพฤกษศาสตร์ ชั้นปีที่ 4 รางวัลรองชนะเลิศ ชื่อผลงาน We are Science, We are the one โดยนายภควต ทวีปวรเดช นักศึกษาคณะวิทยาศาสตร์ สาขาพฤกษศาสตร์ ชั้นปีที่ 3 รางวัลชมเชย ชื่อผลงาน ความสุขเพื่อพระบิดา โดยนายกัมปนาท ใจสมุทร นักศึกษาแพทยศาสตร์สถาบันพระบรมราชชนก ชั้นปีที่3 และโครงการธนาคารความดี มีเพียงรางวัลเดียว คือ รางวัลรองชนะเลิศอันดับ 2 ได้แก่ นายณัฐพงศ์ คำยันต์ นักศึกษาวิทยาศาสตร์ ภาควิชาฟิสิกส์ ทั้งนี้คณบดีคณะต่างๆ แขกผู้มีเกียรติ คณาจารย์ และบุคลากร ได้มาร่วมพิธีทำบุญและแสดงความยินดีเนื่องในโอกาสครบรอบ 51 ปี คณะวิทยาศาสตร์ฯ จำนวน 280 คน
ส่วนในช่วงบ่ายได้จัดให้มีปาฐกถาศาสตราจารย์ ดร. สตางค์ มงคลสุข ครั้งที่ 17 หัวข้อ "สุนทรียภาพแห่งการวิจัย ประสบการณ์ของนักมนุษยศาสตร์" โดย ศาสตราจารย์เกียรติคุณ ดร. เจตนา นาควัชระ หลังจากนั้นก็เป็นพิธีมอบโล่แสดงความยินดีแก่ผู้ที่ได้รับการเชิดชูเกียรติต่างๆ ได้แก่ พิธีมอบโล่เกียรติยศแก่ ศ. นพ. ประสพ รัตนากร และ ศ. กำจร มนุญปิจุ ปูชยนีบุคคลผู้ทำคุณประโยชน์แก่คณะวิทยาศาสตร์ รางวัลศิษย์เก่าดีเด่น จำนวน 4 ท่าน ได้แก่ นายแพทย์สุวิทย์ วิบุลผลประเสริฐ นักวิชาการสาธารณสุข กระทรวงสาธารณสุข ศาสตราจารย์ ดร. วีระพงศ์ ปรัชชญาสิทธิกุล คณบดีคณะเทคนิคการแพทย์ ศาสตราจารย์ ดร. ชัยวัฒน์ ต่อสกุลแก้ว รองปลัดกระทรวงวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี ศาสตราจารย์พิเศษ ทันตแพทย์สิทธิ ส. ศรีโสภาค ราชบัณฑิต ประเภทวิทยาศาสตร์สุขภาพ มอบช่อดอกไม้แสดงความยินดีแก่ผู้ได้รับปริญญาดุษฎีบัณฑิตกิตติมศักดิ์ ได้แก่ ศ. เกียรติคุณ ดร. นพ. พรชัย มาตังคสมบัติ ศาสตราจารย์ ดร. วิสุทธิ์ ใบไม้ และศาสตราจารย์ ดร. ทัสซูจิ เซกิ รางวัลอาจารย์ดีเด่น จากสภาคณาจารย์คณะวิทยาศาสตร์ (ระดับรองศาสตราจารย์) ประจำปี พ.ศ. 2552 ได้แก่ รศ. พิมพ์ใจ ใจเย็น รางวัลอาจารย์ บุคลากรดีเด่น จำนวน 4 ท่าน รางวัลนักศึกษาคณะวิทยาศาสตร์ผู้บำเพ็ญประโยชน์ดีเด่น รางวัลนักศึกษาวิทยาศาสตร์ดีเด่น จำนวน 11 คน รางวัลนักศึกษาผู้มีผลการเรียนดีเด่น จำนวน 13 คน รางวัลนำเสนอผลงานวิชาการในระดับชาติ นานาชาติ จำนวน 22 คน และหลังจากพิธีแสดงความยินดีแก่ผู้ได้รับการเชิดชูเกียรติแล้ว แขกผู้มีเกียรติ ศิษย์เก่า คณาจารย์ และบุคลากร ร่วมสังสรรค์ ณ ลานตึกกลม ซึ่งมีผู้ร่วมงานในช่วงบ่ายจำนวน 827 คน