เมื่อวันที่ 2 มีนาคม 2552 เวลา 09 .00 น. ศ.ศกรณ์ มงคลสุข คณบดี พร้อมด้วยผู้บริหาร อาจารย์ และเจ้าหน้าที่ คณะวิทยาศาสตร์ ม.มหิดล ร่วมวางพานพุ่ม ณ พระบรมรูปสมเด็จพระมหิตลาธเบศร อดุลเดชวิกรม พระบรมราชชนก ณ บริเวณ ชั้น 1 สำนักงานอธิการบดี มหาวิทยาลัยมหิดล ศาลายา เนื่องในวันพระราชทานนามมหาวิทยาลัยมหิดล ครบ 40 ปี ซึ่งในงานนี้ คณะวิทยาศาสตร์ ได้รับรางวัลเว็บไซต์ยอดเยี่ยม ศิษย์เก่ามหาวิทยาลัย ได้รับรางวัลมหิดลทยากร ประจำปี 2551 ได้แก่ ศาสตราจารย์เกียรติคุณดร.พรชัย มาตังคสมบัติ และบุคลากรของคณะ ได้รับประกาศเกียรติคุณจากมหาวิทยาลัยมหิดล ประจำปี 2551 จำนวน 4 ท่าน ได้แก่ ดร.ณัฐพล อ่อนปาน นายพิมล จำนง นายปิยะ โพธิ์สิทธิ์ และนางลาวัลย์ เฮงจินดา นอกจากนี้ คณะยังได้ร่วมจัดนิทรรศการวิชาการโดยนำผลงาน Electronic Nose และ Smart Farm ไปจัดแสดง ด้วย