พระราชดำรัส พระบาทสมเด็จพระปรมินทรมหาภูมิพลอดุลยเดช พระราชทานไว้ให้แก่ชาวคณะวิทยาศาสตร์ทั้งมวลเมื่อ พ.ศ. 2508 เป็นเสมือนแรงกระตุ้นให้คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหิดล มุ่งมั่นดำเนินการให้เป็นไปตามพระราชประสงค์ นับตั้งแต่วันก่อตั้งจนถึงวันนี้ ผ่านมาถึง 6 ทศวรรษ ปณิธานอันยิ่งใหญ่ยังคงได้รับการสานต่อจากรุ่นสู่รุ่นเสมอมา

คณะวิทยาศาสตร์ มหาวิทยาลัยมหิดล มีจุดเริ่มต้นจาก โรงเรียนเตรียมวิทยาศาสตร์การแพทย์เชียงใหม่ ที่จัดการเรียนการสอนด้านวิทยาศาสตร์พื้นฐานและวิชาประกอบอื่นๆ ได้แก่ เคมี ฟิสิกส์ ชีววิทยา คณิตศาสตร์ ภาษาอังกฤษ ให้แก่นักศึกษาทางการแพทย์สาขาต่างๆ จนเกิดเป็นแนวคิดที่จะสร้าง คณะวิทยาศาสตร์ สำหรับมหาวิทยาลัยแพทยศาสตร์ จนมีการก่อตั้งภาควิชาในยุคเริ่มต้นคือ ภาควิชากายวิภาคศาสตร์ ภาควิชาเคมี ภาควิชาชีววิทยา-พฤกษศาสตร์ (ต่อมาแยกเป็นภาควิชาชีววิทยา และ ภาควิชาพฤกษศาสตร์) จนถึงปัจจุบันที่มีถึง 12 ภาควิชา รวมทั้งหน่วยงานอีกมากมายเพื่อรองรับการเรียนการสอนในระดับต่างๆ ตั้งแต่วิชาพื้นฐานทางวิทยาศาสตร์และคณิตศาสตร์ วิชาวิทยาศาสตร์ชีวภาพและปรีคลีนิก และวิทยาศาสตร์การแพทย์หลักสูตรต่างๆ การเรียนการสอนวิทยาศาสตร์ในระดับสูง การวิจัยที่ครอบคลุมตั้งแต่งานวิจัยพื้นฐานจนงานวิจัยประยุกต์เพื่อตอบโจทย์ภาคอุตสาหกรรมและการผลิต และบริการวิชาการเพื่อเผยแพร่ความรู้ทางวิทยาศาสตร์

ตลอดระยะเวลากว่า 6 ทศวรรษ คณะวิทยาศาสตร์แสดงให้สังคมประจักษ์ถึงความสำคัญของ “วิทยาศาสตร์” และ “งานวิจัย” ในการสร้างสรรค์สังคมและประเทศไทยด้วยองค์ความรู้และนวัตกรรม ผลักดันพลวัตของเศรษฐกิจประเทศไทยให้ก้าวหน้าต่อไป ดังเช่นวิสัยทัศน์ที่จะเป็นคณะวิทยาศาสตร์ชั้นนำในระดับสากล